外的其他兽被斗篷收入了水晶球。危急关头，雷贝兽靠敏锐的觉察力打破了水晶球并扫描了幻影兽。众人继续前进，来到了一个有着许多漂浮资料的房间。突然那些资料里出现黑影并向众人伸出黑爪。突然出现了铃铛的声音，黑爪就不动了。山羊兽出现并带众人来到囚禁奥法尼兽的地方。奥法尼兽向大家详细地说明了造成数码世界的危机的经过。此时凯路比兽出现并说出它的真正目的：夺取十斗士之魂并与它收集的大量资料融合来支配数码世界！
第35集 两魂合一！拓也与辉二的究极进化
凯路比兽打算回收所有的十斗士之魂，阿路达兽与贝欧渥鲁夫兽将其带到城外战斗，让其他兽想办法救出奥法尼兽。城外，阿路达兽与贝欧渥鲁夫兽的实力远低于凯路比兽，被打退化并夺去了数码终端器。而纯平想出打碎反射光的墙壁的办法来消除光之牢笼。就在他们快要救出奥法尼兽时，凯路比兽返回并将纯平、友树和辉一的数码终端器夺走。正当它准备夺走泉的终端器时，奥法尼兽冲出来挡住了攻击。奥法尼兽尝试净化凯路比兽但失败了，只好利用凯路比兽对她的爱拿回数码终端器，交给孩子们。然后，奥法尼兽用最后的力量，牺牲自己使拓也和辉二的数码终端器产生变化，并提示他们要将十斗士之魂融合起来。众人在十斗士之魂的帮助下，终于成功使拓也和辉二超越魂进化成凯撒暴龙兽和马格纳伽鲁鲁兽！
第36集 往胜利的飞翔！对决基路比兽之城
凯撒暴龙兽和马格纳伽鲁鲁兽经过奋战打退了凯路比兽，但同时城堡也塌了。辉一不小心从城堡上掉下去，幸好马格纳伽鲁鲁兽及时救了他。在退化后，泉等人的魂又回到了各自的数码终端器里。在泉的鼓励下，辉一打算向辉二道谢。但此时突然从地下冒出冰柱攻击众人。原来是从地下监狱逃脱的冰恶魔兽，是个比凯路比兽更难对付的恐怖数码兽。它封住了拓也和辉二的数码终端器，使他们不能进化。而仙女兽等的实力与其相差甚远。冰恶魔兽更不断地折磨众人，最终惹恼了凯撒狮子兽。在他的奋力攻击下，拓也和辉二脱困，暴雪兽救出了休簇兽和雷光兽，集合四兽的力量终于打败了冰恶魔兽。此时，在上空出现了凯路比兽真正的所在之处。
第37集 决战！生命极限，取回数码世界！
拓也和辉二来到上空与凯路比兽决战。打斗十分激烈，但由于拓也和辉二的配合非常默契，凯路比兽正中威力无比的炎龙击。正当两人以为打败了凯路比兽时，却惊异地见到凯路比兽拥有自我复原能力。而凯路比兽更使用搜集来的数码世界的资料使实力大增，凯撒暴龙兽和马格纳伽鲁鲁兽被打得无还手之力。后来，马格纳伽鲁鲁兽发现了凯路比兽藏在额头里的资料是打败它的关键，于是利用自己的身作盾牌挡住凯路比兽的攻击，让凯撒暴龙兽去接近凯路比兽……马格纳伽鲁鲁兽倒下了：“去吧，拓也！”愤怒的拓也将斗志燃烧成火焰，一击命中凯路比兽的额头，并将其扫描了。然而正当大家欢庆胜利时，真正的阴谋才开始露角……
第38集 没完没了的死斗！光明兽复活的序曲
大家正在高兴时辉二察觉到消失的大地并没有因为凯路比兽被打倒而复原，此时远处的山更被扫描了！大家赶过去后，发现一只叫巴罗兽的数码兽。大家进化后他得知众人是继承十斗士魂的孩子们，于是带大家参观数码世界的历史。众人进一步了解到古代十斗士将光明兽封印的历史，并得知了从头到尾都是光明兽在捣鬼，使凯路比兽变邪恶到处吸取资料，并夺走了凯路比兽被击败后放出的资料以求解开封印而复活。此时该地区的资料也受到了威胁。原来光明兽派出了手下的皇家骑士——丢纳斯兽和领主骑士兽到处吸收资料。为了保护数码世界，众人进化与皇家骑士战斗。没想到皇家骑士的实力超乎想象，连凯撒暴龙兽与马格纳伽鲁鲁兽也被轻易打败。巴罗兽为保护众人而牺牲，而皇家骑士并不罢手，丢纳斯兽用极恐怖的一招将众人打上了天空……
第39集 这里是数码世界！？逃出月球！
辉一醒来后发现大家来到了一个神秘的地方，并为自己没有任何伤而疑惑。众人见到了一些数码兽，得知受到皇家骑士的攻击，大家被空间扭曲带到了数码世界的三个月亮的其中一个。在月亮见到数码世界的资料不断减少，大家都很着急。大家想了许多方法回去，却被围绕“地球”的一条电磁场阻止。后来，听汉堡兽说以前他们的同类移居到“地球”时是在另外两个月亮重叠后的瞬间顺着电磁场做到的。于是大家找到一个火箭，制作了一个巨大弹弓，在准确的时刻弹向地球。没想到在通过电磁场后，却撞上了小行星群，失去动力而漂浮在太空中。幸好这时火箭落到一条铁轨上，在运输兽的帮助下回到了“地球”。
第40集 被选中的人！？操纵天使兽的少年！
大家来到了钢之区域，却突遭人马兽的攻击。此时众人眼前突然出现另外四个孩子。那四个孩子指挥天使兽打跑了人马兽。战后，友树发现其中两个孩子就是常欺负他的铁平和胜春。大家跟他们交谈后，得知当时有许多孩子来到数码世界，但只有拓也等6人继承了十斗士之魂，奥法尼兽就让其他人在森林车站回数码世界。但这4个孩子不想回去，奥法尼兽只好让天使兽保护他们的安全。四人不但不听拓
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